МЕНЮ

Международная научная конференция "Археология Арктики"
19-23 ноября 2017 года
г. Салехард

Молекулярно-генетический анализ палеоДНК в изучении истории заселения ойкумены: возможности и ограничения.

П.А. Сломинский, М.И. Шадрина, М.А. Шульская 

Институт молекулярной генетики РАН, Москва

(slomin@img.ras.ru; shadrina@img.ras.ru; m.shulskaya@gmail.com)

 

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ПАЛЕОДНК В ИЗУЧЕНИИ ИСТОРИИ ЗАСЕЛЕНИЯ ОЙКУМЕНЫ: ВОЗМОЖНОСТИ И ОГРАНИЧЕНИЯ.*

 

*Работа частично финансировалась грантом РФФИ-ЯНАО 16-44-890212.

           

Развитие работ в области генетики человека позволило определить степень генетического родства между современными этническими группами и выявить возможные пути формирования генофонда современного населения ойкумены. Полученные в такого рода исследованиях результаты основаны на анализе ДНК ныне живущих людей и для их проверки было бы крайне важно получить возможность сравнительного анализа ДНК современного человека с ДНК ранее живущих людей, выделенной из различных тканей (в первую очередь – костной ткани). Такой анализ позволит определить изменение генофонда определенного этноса в исторической перспективе, проследить связь между генетической структурой древнего населения с определенными культурными особенностями, выявить изменение генетических особенностей населения определенной территории в исторической перспективе.

            В основе любого исследования древней ДНК (дДНК) из полученных при археологических раскопках биологических остатков лежит метод выделения ДНК, позволяющий получить максимальные количества дДНК при минимальном риске ее контаминации современной ДНК. Выбор того или иного метода выделения зависит от  типа  и характера биологического материала и нами был проведен сравнительный анализ ряда методов выделения дДНК из мумифицированной мышечной ткани обских угров, выявленных в ходе археологических раскопок в поселке Зеленый Яр. В итоге был подобран комбинированный метод с сочетанием экстракции нуклеиновых кислот смесью фенол\хлороформ с последующей очисткой и концентрированием дДНК с использованием микроколонок. В итоге к настоящему времени удалось выделить дДНК и провести ее амплификацию с праймерами на митохондриальную и геномную ДНК из одной мумии. Успешная амплификаци получена только для коротких ампликонов (не более 150 п.н.) как в случае митохондриальной, так и в случае геномной ДНК. Выход ДНК оказался крайне низок - не более 5-10 нг ДНК на 100 мг ткани. Такой низкий выход ДНК может быть обусловлен низкой кислотностью почвы в месте захоронения и использованием бересты для обертывания тела перед захоронением. Возможно, что с течением времени в кислой среде из бересты экстрагируется тритерпеновое соединение бетулин, которое может влиять на  химическую целостность ДНК или блокировать амплификацию. При этом выделенные препараты ДНК содержали блокирующие ПЦР низкомолекулярные соединения и для постановки реакции амплификации необходимо разведение ДНК до концентрации менее 0.1 нг\мкл.

Электронные версии печатных документов

(скачать)